Организационное обеспечение деятельности Второго арбитражного апелляционного суда осуществляет Судебный департамент при Верховном Суде Российской Федерации, действующий на основании Федерального закона от 08.01.1998 № 7-ФЗ «О Судебном департаменте при Верховном Суде Российской Федерации».
Под организационным обеспечением деятельности суда понимаются мероприятия кадрового, финансового, материально-технического, информационного и иного характера, направленные на создание условий для полного и независимого осуществления правосудия.
Судебный департамент призван способствовать укреплению самостоятельности судов, независимости судей и не вправе вмешиваться в осуществление правосудия.
Финансирование суда осуществляется Судебным департаментом в пределах бюджетных ассигнований федерального бюджета.
Полномочия Судебного департамента в части организационного обеспечения деятельности судов:
1) организационно обеспечивает деятельность федеральных судов;
2) разрабатывает и представляет в Правительство Российской Федерации согласованные с Советом судей Российской Федерации предложения о финансировании федеральных судов;
3) изучает организацию деятельности судов и разрабатывает предложения о ее совершенствовании;
4) вносит в установленном порядке в Верховный Суд Российской Федерации предложения о создании либо об упразднении судов;
5) определяет потребность судов в кадрах; обеспечивает работу по отбору и подготовке кандидатов на должности судей; взаимодействует с образовательными организациями, осуществляющими подготовку и повышение квалификации судей и работников аппаратов судов;
6) разрабатывает научно обоснованные нормативы нагрузки судей и работников аппаратов судов;
7) перераспределяет по согласованию с Председателем Верховного Суда Российской Федерации и с учетом мнения председателей федеральных судов образовавшиеся в соответствующих судах вакансии на должности судей, а также при необходимости перераспределяет штатную численность работников аппаратов федеральных судов в пределах их общей штатной численности, предусмотренной федеральным законом о федеральном бюджете на соответствующий год;
8) ведет статистический и персональный учет судей и работников аппаратов судов;
9) утверждает техническое описание мантии судьи и образцов предметов служебного обмундирования судей и имеющих классные чины работников аппаратов судов по согласованию с Советом судей Российской Федерации и Геральдическим советом при Президенте Российской Федерации, а также утверждает порядок и нормы обеспечения судей мантиями, служебным обмундированием судей и имеющих классные чины работников аппаратов судов, порядок их ношения и случаи обязательности ношения служебного обмундирования судьями по согласованию с Советом судей Российской Федерации;
10) утверждает типовой должностной регламент федерального государственного гражданского служащего, замещающего должность федеральной государственной гражданской службы руководителя аппарата — администратора суда;
11) организует делопроизводство и работу архивов судов, ведет судебную статистику;
12) организует строительство зданий, а также ремонт и техническое оснащение зданий и помещений судов;
13) организует разработку, внедрение и обеспечение функционирования программно-аппаратных средств, необходимых для ведения судопроизводства и делопроизводства, а также информационно-правового обеспечения судебной деятельности; организует и осуществляет мероприятия по формированию единого информационного пространства федеральных судов и мировых судей, поддержке функционирования и развитию Государственной автоматизированной системы Российской Федерации «Правосудие»; обеспечивает в пределах своих полномочий доступ к информации о деятельности судов;
14) принимает во взаимодействии с судами, органами судейского сообщества и правоохранительными органами меры по обеспечению независимости, неприкосновенности и безопасности судей, а также безопасности членов их семей;
15) организует материальное и социальное обеспечение судей, в том числе пребывающих в отставке, работников аппаратов судов, принимает меры по обеспечению указанных лиц, нуждающихся в жилых помещениях, благоустроенными жилыми помещениями в соответствии с федеральным законодательством, устанавливает порядок признания судей нуждающимися в жилых помещениях в целях предоставления единовременной социальной выплаты для приобретения или строительства жилых помещений либо предоставления жилых помещений в собственность, порядок признания судей не имеющими жилых помещений по месту нахождения суда в целях предоставления служебных жилых помещений, порядок принятия судей на учет в качестве нуждающихся в жилых помещениях в целях предоставления единовременной социальной выплаты для приобретения или строительства жилых помещений либо предоставления жилых помещений в собственность, порядок принятия судей на учет в качестве не имеющих жилых помещений по месту нахождения суда в целях предоставления служебных жилых помещений, порядок ведения соответствующих видов учета и порядок принятия решений о предоставлении судьям единовременной социальной выплаты для приобретения или строительства жилых помещений, о предоставлении судьям жилых помещений в собственность и служебных жилых помещений, а также устанавливает основания и условия предоставления судьям дополнительной площади служебного жилого помещения;
16) организует в соответствии с федеральным законодательством предоставление медицинской помощи судьям, в том числе пребывающим в отставке, членам их семей, работникам аппаратов судов, а также санаторно-курортное лечение указанных лиц, для чего вправе создавать санаторно-курортные организации;
17) устанавливает и развивает связи с государственными и иными органами, учреждениями и организациями, в том числе иностранными, в целях совершенствования организации работы судов;
18) взаимодействует с адвокатурой, правоохранительными и другими государственными органами по вопросам надлежащего обеспечения деятельности судов;
19) финансирует возмещение издержек по делам, рассматриваемым судами, которые относятся на счет федерального бюджета;
20) осуществляет иные меры по обеспечению деятельности судов.

Судебный департамент при Верховном Суде Российской Федерации:
место нахождения и почтовый адрес – 107996, г. Москва, ГСП-6, ул. Гиляровского, д. 31, к. 2;
адрес сайта – http://www.cdep.ru/